Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms