Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms