Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms