Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTPAP49638 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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