Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms