Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms