Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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