Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARL1P40616 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARL1P40616 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARL1P40616 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms