Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFBP38117 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFBP38117 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms