Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms