Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM23P36406 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM23P36406 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms