Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms