Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.8 ms