Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP1P29466 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms