Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms