Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1BP28222 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms