Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms