Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMO2P25791 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMO2P25791 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO2P25791 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms