Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRCP23327 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRCP23327 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRCP23327 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms