Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCLP18206 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCLP18206 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCLP18206 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms