Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2P0DI81 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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