Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM228BP0C875 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms