Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms