Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.6 ms