Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC24AO95486 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC24AO95486 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms