Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms