Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms