Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms