Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDAC3O15379 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC3O15379 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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