Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FFAR3O14843 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FFAR3O14843 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FFAR3O14843 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms