Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F3O00716 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F3O00716 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms