Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP29-1A8MX34 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms