Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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