Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms