Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAXBP1Q9Y5B6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms