Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms