Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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