Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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