Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms