Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHST12Q9NRB3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms