Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms