Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf49Q9H6J7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms