Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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