Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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