Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMIM3Q9BZL3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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