Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms