Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms