Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms