Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms