Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FGD4Q96M96 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FGD4Q96M96 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms